Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
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Krtap5-3Q9D226 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Krtap5-3Q9D226 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Krtap5-3Q9D226 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Krtap5-3Q9D226 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Krtap5-3Q9D226 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Krtap5-3Q9D226 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Krtap5-3Q9D226 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Krtap5-3Q9D226 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Krtap5-3Q9D226 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Krtap5-3Q9D226 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms