Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ifitm1Q9D103 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ifitm1Q9D103 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms