Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Arv1Q9D0U9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Arv1Q9D0U9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms