Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem88Q9D0N8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem88Q9D0N8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms