Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2e1Q9D0D5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2e1Q9D0D5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms