Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nde1Q9CZA6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nde1Q9CZA6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms