Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prelid3bQ9CYY7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prelid3bQ9CYY7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms