Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hdhd3Q9CYW4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hdhd3Q9CYW4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms