Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CYI0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CYI0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9CYI0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CYI0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CYI0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CYI0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms