Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXS4

Cenpv, Centromere protein V, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpvQ9CXS4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CenpvQ9CXS4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpvQ9CXS4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms