Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Exo5Q9CXP9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Exo5Q9CXP9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Exo5Q9CXP9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms