Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc3Q9CXE6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms