Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prdm5Q9CXE0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prdm5Q9CXE0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms