Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RpainQ9CWY9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RpainQ9CWY9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms