Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cxxc1Q9CWW7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cxxc1Q9CWW7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cxxc1Q9CWW7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms