Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BccipQ9CWI3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BccipQ9CWI3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms