Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NmbQ9CR53 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NmbQ9CR53 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms