Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Klhl28Q9CR40 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms