Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Atp5f1Q9CQQ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms