Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rdm1Q9CQK3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rdm1Q9CQK3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms