Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9CQF4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Q9CQF4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQF4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQF4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CQF4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQF4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CQF4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CQF4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms