Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9CQC3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQC3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CQC3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9CQC3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9CQC3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms