Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Chchd1Q9CQA6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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