Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NepnQ9CQ76 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NepnQ9CQ76 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms