Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
1700029P11RikQ9CQ68 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700029P11RikQ9CQ68 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms