Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Mrpl49Q9CQ40 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl49Q9CQ40 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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