Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pole4Q9CQ36 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pole4Q9CQ36 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pole4Q9CQ36 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms