Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chmp3Q9CQ10 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chmp3Q9CQ10 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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