Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc198Q9CPZ1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc198Q9CPZ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms