Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ska1Q9CPV1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ska1Q9CPV1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms