Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ5

Cenpq, Centromere protein Q, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpqQ9CPQ5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CenpqQ9CPQ5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CenpqQ9CPQ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms