Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trim12aQ99PQ1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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