Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim26Q99PN3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim26Q99PN3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.3 ms