Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gtf2a1Q99PM3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2a1Q99PM3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms