Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cep41Q99NF3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cep41Q99NF3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.5 ms