Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NsmfQ99NF2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NsmfQ99NF2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms