Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b1Q99NB9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b1Q99NB9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b1Q99NB9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms