Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Acss1Q99NB1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Acss1Q99NB1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acss1Q99NB1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms