Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Pcgf6Q99NA9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pcgf6Q99NA9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms