Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Brms1Q99N20 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms