Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a8Q99N10 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ms4a8Q99N10 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms