Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BrapQ99MP8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BrapQ99MP8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms