Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Atp1b4Q99ME6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atp1b4Q99ME6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms