Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tm2d1Q99MB3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tm2d1Q99MB3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tm2d1Q99MB3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms