Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RtcbQ99LF4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms