Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pagr1aQ99L02 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pagr1aQ99L02 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms