Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajb11Q99KV1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dnajb11Q99KV1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms