Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vmp1Q99KU0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmp1Q99KU0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms