Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PpifQ99KR7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PpifQ99KR7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms