Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ciao1Q99KN2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ciao1Q99KN2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms